L’approche pédagogique dispensée à L’Autre École est fondée sur de nombreuses études réalisées en matière d’éducation, y compris les plus récentes. Elle comporte une attention particulière portée aux pédagogies positives et alternatives centrées sur l’enfant (Montessori, Freinet, Steiner, Decroly, Malaguzzi…). L’Autre École fixe son cadre pédagogique au contact d’un collège pluridisciplinaire d’experts composé d’enseignants, de pédagogues, de chercheurs en neurosciences, de pédopsychiatres, de philosophes et de parents.